Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CICQ96RK0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CICQ96RK0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms