Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
LMTK3Q96Q04 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms