Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms