Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms