Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCLT1Q96NL6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCLT1Q96NL6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms