Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms