Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf36Q96KX1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf36Q96KX1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms