Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAGED4Q96JG8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms