Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms