Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RBM17Q96I25 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM17Q96I25 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms