Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BCANQ96GW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms