Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX27Q96GQ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX27Q96GQ7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms