Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD1Q96GM5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD1Q96GM5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMARCD1Q96GM5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD1Q96GM5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD1Q96GM5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD1Q96GM5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD1Q96GM5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD1Q96GM5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD1Q96GM5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD1Q96GM5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms