Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms