Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTP4Q96DX8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTP4Q96DX8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms