Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX58Q96C10 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX58Q96C10 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms