Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC59Q96AG4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms