Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35C1Q96A29 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35C1Q96A29 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms