Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UTP4Q969X6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms