Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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TRIM63Q969Q1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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TRIM63Q969Q1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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