Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HPS3Q969F9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms