Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25Q93038 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms