Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIT1Q92963 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIT1Q92963 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms