Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CSRNP3Q8WYN3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms