Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms