Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKIN2Q8WXE0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms