Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms