Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms