Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF2Q8TEC5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms