Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms