Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms