Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms