Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP2Q8ND30 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP2Q8ND30 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms