Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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