Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms