Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM2Q8N271 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PROM2Q8N271 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms