Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms