Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD3Q8N144 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms