Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT20Q8IY31 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms