Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms