Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms