Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP4Q8IVH2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP4Q8IVH2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms