Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM3Q86VH5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms