Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PBRM1Q86U86 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PBRM1Q86U86 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PBRM1Q86U86 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PBRM1Q86U86 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms