Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms