Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRADAQ7RTN6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms