Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms