Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms