Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BRINP3Q76B58 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms