Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms